長野県の旧家で、中学3年の長女が殺害されるという事件が発生した。 犯人の逃走経路は不明。事件現場は完全な密室で第一発見者の父に娘殺しの疑いがかかる。 昨日まで平和に暮らしていた普通の一家にいったい何が起きたのか。

パン屋の店員チャーリイは32歳だが、知能障害を持っているために6歳児並みの知能しか持っていなかった。 チャーリイはもっと賢くなって周りの人たちと仲良くなりたいと願っている。 そんな彼に、画期的な脳外科手術を受ければ頭がよくなるかもしれないと告げ…